Pakoštane má dobré podmínky pro vodní sporty jako potápění, podmořský rybolov i rybaření na sladkovodním Vranském jezeře, windsurfing, jachting či vodní skútry. Vyznavači aktivní dovolené v Pakoštane mohou využít i hřiště pro plážový volejbal, tenis, stolní tenis a jiné míčové hry nebo také zastřílet si na střelnici.

Pakoštane je ideálním výchozím bodem pro milovníky cyklistiky, neboť kolem nedalekého Vranského jezera byly vybudované cyklistické stezky. Rekreační stezka vede z Pakoštane do Biogradu po tzv. Makadamově cestě. Druhá 38km stezka již vede okolo jezera a na několika odbočkách je možné zajet k břehu jezera. Na tuto stezku navazuje stezka, která vede i odlehlejšími a vyvýšenými místy v okolí Vranského jezera. Z ní si cykloturisté užijí nádherné výhledy na jezero i moře a skupiny blízkých ostrovů. Celková délka této trasy, na níž je nejhezčí vyhlídka Kamenjak, je dlouhá 43 km.